Фонд самиздата (ФС) начал формироваться в 1992 году. Главным источником поступления материалов в Фонд стали личные архивы петербуржцев, в 1950-80-е годы собиравших, тиражировавших и распространявших самиздат. В состав ФС вошла также часть архива Клуба-81.
Основной массив собрания состоит из машинописных текстов. Часть материалов изготовлена фотоспособом и при помощи различной множительной техники (ксерокс, АЦПУ и пр.). Некоторые тексты переписаны от руки.
В Фонде представлен литературно-художественный, религиозно-философский и общественно-политический самиздат. Отдельной частью ФС является самиздат периода «перестройки».
Собрание литературно-художественного самиздата включает в себя, во-первых, произведения русских писателей и поэтов первой половины и середины ХХ века, которые либо никогда не печатались в официальных советских изданиях, либо публикации этих произведений были малодоступны. Это произведения А. Ахматовой, М. Булгакова, О. Мандельштама и т. д. Во-вторых, стихи, прозу, статьи и переводы авторов, участвовавших в неофициальном культурном движение (большая их часть состояла в Клубе-81). Среди них Б. Дышленко, В. Кривулин, Е. Шварц и мн. др. В третьих, сочинения литераторов второй половины прошлого века, состоявших в ССП или исключенных из его рядов, не печатавшиеся в СССР официально. Это сочинения В. Войновича, Б. Слуцкого, А. Солженицына и др.
Среди литературных материалов отдельные произведения, сборники и периодические издания. В ФС собрано более 50 номеров литературно-художественного журнала «Часы», номера журналов «Обводный канал», «Митин журнал» и т. д.
Религиозно-философский самиздат представлен, главным образом, не издававшимися в СССР сочинениями русских религиозных философов первой половины ХХ века (Н. Бердяева, о. С. Булгакова, о. П. Флоренского и др.) и текстами философов и богословов 1960-80-х (Т. Горичевой, Г. Померанца и пр.), написанными для самиздата. Входят в состав ФС также самиздатские перепечатки текстов молитв, переводы восточных религиозно-философских произведений и т. п.
Собрание общественно-политического самиздата состоит в основном из документов правозащитного движения, перепечаток эмигрантских публикаций (тамиздата) и периодики (отдельные номера «Хроники текущих событий» и журнала «Поиски», комплект журнала «Сумма» и т. д.).
Большая часть материалов ФС разделена на персональные собрания лиц, хранивших в своих архивах самиздат. Это собрания О. Абрамович, С. Коровина, С. Левина и т. д.
Самиздатская периодика хранится отдельно.
В собрание самиздата периода «перестройки» входят преимущественно материалы общественно-политических объединений, возникших в конце 1980-х. В самиздате распространялись их программные документы, листовки, периодическая печать и т. п.
Этот самиздат сгруппирован по объединениям, распространявшим свои материалы. Среди таких объединений Демократический Союз, Ленинградский Народный Фронт, различные профсоюзные организации и т. д. Из периодических изданий времени «перестройки» в ФС собраны журналы «Демократия и мы», «Красный щедринец», «Меркурий», издания Информационного агентства СМОТа (Свободного межпрофессионального объединения трудящихся) и т. д.
Материалы ФС каталогизированы еще не полностью. Работа по каталогизации Фонда продолжается.
ФС связан с фондом «Б», т. к. политзаключенные 1950-80-х нередко были авторами и распространителями самиздата, а материалы из их личных архивов, как правило, содержат самиздат. Среди них В. Долинин, В. Иофе, А. и И. Цурковы и др.
В настоящее время основным источником пополнения ФС остаются личные архивы читателей самиздата.
ФС включает в себя свыше 1000 единиц хранения.